公司為獨立之法人組織，其資金若與經營者、股東或任何他人之資金相互流用，可能涉及資金貸與，應依相關法令規定設算利息收入或調減利息支出。

依所得稅法第24條之3第2項規定，公司之資金貸與股東或任何他人未收取利息，或約定之利息偏低者，除屬預支職工薪資者外，應按資金貸與期間所屬年度1月1日臺灣銀行之基準利率（108及109年度均為2.616%），計算公司利息收入課稅。

又依營利事業所得稅查核準則（下稱查核準則）第97條第11款規定，如果公司一方面借入款項支付利息，一方面貸出款項並不收取利息，或收取利息低於所支付之利息者，就相當於該貸出款項支付之利息或其差額，不予認定。

實務上查核營利事業所得稅結算申報案件時，發現有公司代股東或他人墊付款項，帳列「暫付款」，該等代他人墊付款項之行為，雖非直接將資金借給股東或他人使用，仍屬資金貸與性質，如雙方約定未收取利息或收取之利息偏低，且公司本身並無借入款項，則應依所得稅法第24條之3第2項規定，計算利息收入課稅。

若公司本身有借入款項，則應依查核準則第97條第11款規定，就相當於貸出款項支付之利息或其差額予以調減利息支出。

該局舉例說明，甲公司108年1月1日代股東墊付款項500萬元，迄至年底該股東仍未償還且甲公司未向該股東收取利息：

（1）若甲公司帳上並無借入款項，其於辦理營利事業所得稅結算申報時，即應依所得稅法第24條之3第2項規定，設算調增利息收入130,800元【5,000,000元ｘ2.616%＝130,800元】。

（2）若甲公司帳上另有600萬元之銀行借款，且該筆借款之借款利率為2%，則應依查核準則第97條第11款規定，就相當於貸出款項500萬元支付之利息予以調減利息支出100,000元【5,000,000元ｘ2%＝100,000元】。

該局提醒，營利事業若有資金貸與股東或任何他人，而未收取利息或約定利息偏低之情形，應依所得稅法或查核準則等相關規定，自行設算調增利息收入或調減利息支出，以免遭核定補稅。