近期有民眾將持有適用房地合一稅制之土地自行興建房屋後(下稱自地自建)，連同其他名下數筆土地一併出售，於申報房地合一稅時，誤將所移轉之其他房地，全數依較低稅率20%申報繳納稅額，經國稅局查獲，遭補徵本稅。
財政部高雄國稅局說明，個人自地自建，自土地取得日起算5年內完成並銷售該房屋、土地者，依所得稅法第14條之4第3項第1款第6目及房地合一課徵所得稅申報作業要點第19點規定，適用稅率20%，惟僅限自行興建之房屋及其坐落基地。
該局舉例說明，納稅義務人甲君於112年10月各以新臺幣(下同)500萬元，購入A、B地號共2筆土地(合計1,000萬元)，113年6月興建C房屋、同年12月取得使用執照，建築成本500萬元，嗣於114年6月出售A、B 2筆土地及C房屋，買賣總價2,250萬元(含B地價額750萬元)。甲君於申報房地合一稅時，申報成交價額2,250萬元、取得成本1,500萬元、必要費用90萬元及可減除移轉費用30萬元，課稅所得額630萬元，按稅率20%計算繳納稅額126萬元；惟該局查核時發現C房屋所坐落基地為A土地，僅A土地及C房屋符合上述規定適用稅率20%，經該局重新核算屬B土地課稅所得額為210萬元｛售價750萬元–成本500萬元–必要費用及可減除移轉費用40萬元〔＝90萬元×500萬元/1,500萬元+30萬元×750萬元/2,250萬元〕｝，持有期間自112年10月至114年6月，未超過2年，適用稅率為45%，核定補徵稅額52.5萬元[課稅所得額210萬元*(適用稅率45% -申報稅率20%)]。
該局特別提醒，民眾將數筆土地併同自地自建之房地出售時，應確認其各房地是否符合上述情形，按正確適用稅率繳稅，以免遭稽徵機關核定補稅。民眾如有疑義，可撥打免費服務電話0800-000321洽詢，或至該局網站(https://www.ntbk.gov.tw)利用國稅智慧客服「國稅小幫手」線上查詢。
