本局表示，營利事業辦理所得稅結算或決算申報時，僅申報減除依法律規定之投資抵減稅額，因無所得基本稅額條例第7條第1項各款規定所得額，而未依該條例規定申報及繳納基本稅額，經稽徵機關調查，發現漏報基本所得額後，營利事業始申請更正調減當年度已申報抵減之投資抵減稅額者，稽徵機關依財政部100年7月26日台財稅字第10004063150號令，應否准更正；其有應補徵之基本稅額者，並應依同條例第15條第2項規定處罰。
     本局舉例說明，甲公司103年度營利事業所得稅結算申報課稅所得額為100萬元，應納稅額17萬元，且申報減除投資抵減稅額17萬元，一般所得稅額為0元（17萬元-17萬元），因無同條例第7條第1項各款規定所得額，誤以為不用申報所得基本稅額。惟事後經稽徵機關調查，發現甲公司漏未申報基本稅額6萬元[(100萬元-50萬元)×12%]，經核定應補徵基本稅額與一般所得稅額之差額6萬(6萬元-0元)，並按補徵稅額處3倍以下之罰鍰，甲公司經稽徵機關調查後，雖申請更正調減已申報抵減之投資抵減稅額，惟依前揭令釋規定，應否准更正。
     本局特別提醒，營利事業申報減除投資抵減稅額者，應同時申報所得基本稅額，以免經稽徵機關調查發現有漏報基本稅額，按未申報規定裁罰，影響自身權益。