財政部南區國稅局新營分局表示，營利事業出售採用權益法之投資時，其成本認定，依所得稅法第45條規定，應以出價取得之原始成本作為計算出售資產損益之基礎，而非財務報表所列投資之帳面價值。

營利事業持有採用權益法之投資時，依財務會計規定，財務報表上投資之帳面金額會隨被投資公司股東權益的變動而增減，當出售時亦係以投資之帳面價值為出售成本。惟辦理營利事業所得稅結算申報時，依所得稅法相關規定，該投資之出售成本則應以原始取得價格計算出售資產損益。 

該分局舉例說明，甲公司105年出售對乙公司採用權益法之投資，出售金額1,600,000元，原始取得成本1,000,000元，財務報表之投資帳面金額則為2,000,000元，而稅務上應認列是出售資產增益600,000元（1,600,000-1,000,000），而非財務上出售資產損失400,000元（1,600,000-2,000,000）。故特別呼籲結算申報時要注意稅務會計與財務會計的差異。