財政部臺北國稅局表示，為促進產業創新或中小企業研發創新，營利事業依產業創新條例第10條第1項或中小企業發展條例第35條第1項規定，當年度投資於研究發展之支出，得選擇於支出金額15%限度內，抵減當年度應納營利事業所得稅額；或於支出金額10%限度內，自當年度起3年內抵減各年度應納營利事業所得稅額。營利事業應特別注意上述抵減方式一經擇定不得變更，且無論選擇何抵減方式，申報抵減稅額均以當年度結算申報應納營利事業所得稅額之30%為限。

　　該局舉例說明，甲公司111年度營利事業所得稅結算申報應納稅額為新臺幣(下同)400,000元，其經主管機關認定符合研究發展活動之研究發展支出金額為2,000,000元，甲公司如選擇採研究發展支出金額15%限度內抵減當年度(即111年度)應納稅額，其111年度投資抵減稅額雖為300,000元（2,000,000元×15%），惟因超過111年度應納稅額之30%即120,000元（400,000元×30%），故甲公司111年度可抵減應納稅額之金額為120,000元，且其餘投資抵減稅額180,000元(300,000元-120,000元)不得供以後年度抵減；甲公司如選擇於研究發展支出金額10%限度內抵減應納稅額，則甲公司111年度投資抵減稅額為200,000元（2,000,000元×10%），於限額內抵減111年度應納稅額120,000元後，剩餘投資抵減稅額80,000元(200,000元-120,000元)，可留供以後2年度(即112至113年度)抵減各該年度應納稅額。

　　該局特別提醒，營利事業適用研發支出投資抵減之抵減方式，應於辦理當年度營利事業所得稅結算申報時擇定，且在結算申報期間屆滿後即不得變更，請營利事業注意相關規定，以免影響租稅優惠權益。