台資企業在中國大陸投資賺錢，回到台灣報稅時，想要主張在大陸已經繳稅以減免營所稅，台北國稅局指出，此時要留意「稅基」的差異，不能直接用全額收入申報抵減，還得同步列舉相關成本，算出可抵稅的所得比例，以免遭調整補稅。

台北國稅局近期查核發現，甲公司2017年的營所稅申報案中，從大陸拿到1,280萬元技術服務收入，大陸客戶匯出時就已經被扣繳10％稅款，換算為新台幣約為130萬元，這間公司也如實以130萬元申報抵稅。

然後國稅局實際查核後，官員指出，發現這筆技術服務收入，依《所得稅法》規定，還要再減除790萬元相關成本，剩下的490萬元才算是所得，最後核算出甲公司的抵稅上限只有83萬元左右，因此對甲公司補稅47萬元。

官員表示，依據《台灣地區與大陸地區人民關係條例》第24條規定，營利事業取得大陸地區支付的收入，要併同台灣地區來源所得，計算課徵所得稅；不過為了消除重複課稅的問題，在大陸地區已經繳過的稅，可以從應納營所稅當中扣抵。

然而能夠抵減的額度是有限制的，官員表示，為了避免大陸收得稅較重，害台灣這邊收不到稅，兩岸人民關係條例也規定，企業在大陸地區的所得，換算為台灣地區適用營所稅率後，算出來的額度，即是抵減上限。

官員表示，除了額度上限外，還要注意計算的基準是「所得」，因此不能用原始收入計稅，還得再將收入減除成本、費用或損失等，再以算出來的所得額計算抵稅上限。