常有民眾認為，在自家房屋開店營業後，未至國稅局辦理營業登記，以為只要營業稅籍檔查無資料，房屋稅即可繼續以原住家用稅率課徵。

雲林縣稅務局表示，房屋稅係以建物實際使用情形認定稅率，不以國稅局營業稅籍資料為限，如實際建物面積已營業使用，不論國稅局營業稅籍資料如何，皆應以營業稅率課徵房屋稅。如果已向國稅局辦竣停業、註銷或遷出之登記，現場應整理為可供住家使用之樣貌，才可以申請變更為住家用稅率課稅，若現場仍有營業使用跡象，仍應按營業用稅率課徵房屋稅。

該局進一步說明，依房屋稅條例第5條規定，房屋同時作住家及非住家用者，應以實際使用面積，分別按住家用及非住家用稅率，課徵房屋稅。但非住家用者，課稅面積最低不得少於全部面積6分之1。