財政部中區國稅局表示，公司依證券交易法或公司法規定發行員工認股權憑證，員工依公司所定之認股辦法行使認股權取得股票，執行權利日標的股票之時價超過員工認股價格之差額部分，核屬所得稅法第14條第1項第10類規定之其他所得，應計入執行年度或交付股票年度員工之所得額，依法課徵所得稅。

中區國稅局舉例說明，納稅義務人甲君於105年間行使員工認股權取得A公司股票，實質上係A公司給予甲君之報酬，但以實物方式給付，而甲君取得認購股票時，A公司交付股票日之時價超過甲君認股價格之差價利益所得即告實現，A公司已依規定，按前揭差價計算甲君行使員工認股權之其他所得8百餘萬元，並開立各類所得扣繳暨免扣繳憑單與甲君，惟甲君漏未申報，經該局核定甲君之其他所得8百餘萬元，並補徵稅額及裁處罰鍰。

該局特別提醒，納稅義務人如有依公司所定之認股辦法行使認股權取得股票，執行權利日股票之時價超過認股價格之差額部分，應屬所得稅法第14條第1項第10類規定之其他所得，應列入執行年度或取得股票年度之所得額，依法報繳個人綜合所得稅，以免受罰。